主要并发症包括肠出血为较常见的严重并发症。肠穿孔为最严重的并发症，发生率约3%～4%，多见于病程第2～4周，好发于末段回肠。中毒性肝炎，相当多见的并发症。中毒性心肌炎，见于病程第2～3周，有严重毒血症的患者。支气管炎多见于病程早期，支气管肺炎则以极期或病程后期较多见。通常是继发感染，极少由伤寒杆菌引起。
