直线制组织机构的主要优点是结构简单、权利集中、易于同一指挥、隶属关系明确、职责分明、决策迅速。
职能制组织机构的主要优点是强调管理业务的专门化，注意发挥各类专家在项目管理中的作用。矩阵制组织机构的优点是能根据工程任务的实际情况灵活地组建与之相适应的管理机构，具有较大的机动性和灵活性。
矩阵中的每一个成员都受项目经理和职能部门经理的双重领导。强矩阵制项目经理由企业最高领导任命，并全权负责项目。项目经理直接向最高领导负责，项目组成员的绩效完全由项目经理进行考核，项目组成员只对项目经理负责。
